病理诊断中心是九州医检的重点发展学科，按照：国家《病理诊断中心基本标准》、ISO15189认可、CAP认可、ⅡB级100%外排实验室等多标准要求建立，实验室共计1100余平米，由组织病理、细胞病理、分子遗传学和细胞遗传学等多学科共同组成，为光大临床医生和患者提供高水平的病理诊断和会诊服务。

检验项目：开展了脱落细胞学诊断（妇科、非妇科）液基薄层细胞学诊断（妇科、非妇科）、体液细胞学诊断、穿刺细胞学诊断、拉网细胞学诊断；手术标本组织学诊断（大、中、小标本）、活检术组织学诊断、穿刺组织组织学诊断、内镜活检组织组织学诊断、骨髓活检组织学诊断、免疫组织化学染色诊断、冰冻切片诊断等。

仪器设备：拥有Leica系列、Thermo系列、尼康系列、奥林巴斯系列等国际**仪器设备。

分子病理隶属于病理诊断中心，是应用分子生物学技术，从基因水平上检测细胞和组织的分子遗传学变化，以协助病理诊断和分型、指导靶向治疗、预测治疗反应及判断预后的一种病理诊断技术。